在此之前，明代周汝登和明清之际的孙奇逢分别著有《圣学宗传》和《理学宗传》两书，评述明代儒学。而黄宗羲认为这两书都写得“疏略”，故另撰《明儒学案》。

　　《明儒学案》凡六十二卷，据明儒各家治学宗旨分类，共列祟仁、白沙、河东、三原、姚江、浙中王门、江右王门、南中王门、楚中王门、北方王门、粤闽王门、止修、泰州、扩泉、诸儒、东林、蕺山十七个学案。每案先列小序，介绍所述学案的源流、要旨及其特点；次为该案的主要学者小传，论其生平、思想、重要著作等；最后摘录他们的文集、语录，用以反映各案学者的基本学术状况，黄宗羲自加按语，就其长短得失进行评价，既表明了作者本人的思想观点，也便于读者阅读了解。此外，书中还前列“师说”，后设附案，分别介绍作者认为有别于各案人物的有关学者的情况。全书总共评述了有明一代两百余名重要学者的学术活动及其学术思想。

　　黄宗羲治学反对“倚门傍户，依样葫芦”，而主张独立研究，各抒己见。故书中对明儒的“一偏之见”、“相反之论”都很重视，并以此作为设立学案的根据(《凡例》)。对各家思想、宗旨的独到之处和超人之见，作者多一一列出，予以评论，很有学术价值。

　　黄宗羲之学深受王阳明的影响，他对明代理学评价甚高，认为“有明文章事功，皆不及前代，独于理学，前代之所不及也”(《凡例》)。书中推祟王学，而对持程朱之说的学者，则往往“阴致微词”，存在着明显的门户之见。《四库全书总目》对其偏颇之处论列颇详。另外，本书未为李贽立案，也反映了作者识见欠妥之处。

　　《明儒学案》前有乾隆四年(1739)的慈溪郑性刻本、《四库全书》本，以后的《四部备要》和《国学基本丛书》都收录此书。1985年中华书局出版点校本，精装两册，后附人名索引。